Библиотечный фонд - это основа информационных ресурсов библиотеки
Объём библиотечного фонда МБУК «ЦБ» по состоянию на 01.01.22 г. – 88635 экз. К услугам пользователей Библиотеки около 74 тыс. томов книг и более 100 названий периодических изданий разнообразной тематики.
Фонд редких книг начал формироваться с первых дней существования Центральной библиотеки и по состоянию на 01.01.22 г. составляет 3346 экз., в том числе 569 экз. - особо ценных изданий. Это книги XIX - начала XX вв. на русском и иностранных языках и издания военных лет (1941 – 1945 гг.). Есть в фонде прижизненные издания русских классиков, книги с автографами, маргиналиями, экслибрисами, печатями Берлинской королевской домашней библиотеки, материалы по восстанию декабристов 14 декабря 1825 г. - воспоминания участников и следственные дела. Документы из фонда редких книг постоянно экспонируются на выставках в Центральной библиотеке.
В целях предоставления удаленного доступа к информации и сохранности особо ценных изданий осуществляется оцифровка фонда редких книг.
Фонд краеведческих документов насчитывает 4424 экз. и включает книги, местные и региональные периодические издания, неопубликованные документы по истории города и Научного центра, уникальные фотоматериалы из архива старожила города Н. В. Печникова, отражающие этапы строительства Пущино (631 фото), материальные объекты - фрагменты древней керамики, каменные наконечники стрел, орудия труда и предметы быта, монеты, и т. д., найденные во время краеведческих экскурсий, полученные в дар от читателей.
В 2001 г. организована краеведческая экспозиция по истории усадьбы «Пущино». Основа её – авторская выставка материалов реставрации усадьбы заслуженного архитектора РСФСР Е. А. Архипова и архитектора А. Е. Архипова.
В фонде хранится подлинный дневник политрука В. Еськина («Страницы битвы за Москву, ноябрь-декабрь 1941 г.»).
Материалы краеведческого фонда экспонируются на выставках, демонстрируются слушателям краеведческого лектория, посетителям экскурсий. Фонд постоянно пополняется дарами наших читателей.